
[7] CB-LGBM 앙상블
| 모델 | 파라미터 | 조정값 | 설정 목적 |
CB |
depth | 7 | 비선형 상호작용 포착 강화 |
| iterations | 600 | 충분한 학습 반복 | |
| learning_rate | 0.05 | 안정적 수렴 | |
| l2_leaf_reg | 5 | 정규화를 통한 과적합 방지 | |
| LGBM | max_depth | 6 | 트리 복잡도 제한으로 과적합 방지 |
| min_child_samples | 20 | 충분한 샘플에서만 분기하여 노이즈 억제 | |
| subsample | 0.6 | 샘플 부분 학습으로 분산 감소 | |
| colsample_bytree | 0.6 | 특정 feature 의존도 완화 | |
| learning_rate | 0.05 | 수렴 안정성과 표현력 균형 | |
| scale_pos_weight | ≈ 10.07 | 심한 클래스 불균형 보정 |
High Recall Filtering (threshold = 0.05~0.07)
확률이 낮아도 epitope가능성이 있으면 일단 포함하는 회수 단계
→ 초기 epitope 스크리닝, in silico 후보 풀 생성, 후속 필터링(wet-lab, 구조 기반 분석 등)이 가능한 상황
장점: 중요한 epitope 손실 위험 최소화, 탐색 공간을 넓게 확보
단점: Precision 낮음, False Positive 다수 포함
| 기준 | Recall ≥ 0.85 AND MCC ≥ 0.30 |
| 목적 | False Negative 최소화 |
| 사용 시점 | 초기 epitope 스크리닝 단계 |
| 모델 역할 | 후보 epitope 최대한 확보 |
| 임계값 | 0.05 |
| 성능지표 | Precision = 0.21 Recall = 0.91 MCC = 0.39 |
| 해석 | epitope 후보 최대 확보 |
| 문제 설명 | solution.py |
| #122 완호가 관리하는 어떤 데이터베이스의 한 테이블은 모두 정수 타입인 컬럼들로 이루어져 있습니다. 테이블은 2차원 행렬로 표현할 수 있으며 열은 컬럼을 나타내고, 행은 튜플을 나타냅니다. 첫 번째 컬럼은 기본키로서 모든 튜플에 대해 그 값이 중복되지 않도록 보장됩니다. 완호는 이 테이블에 대한 해시 함수를 다음과 같이 정의하였습니다. (1) 해시 함수는 col, row_begin, row_end을 입력으로 받습니다. (2) 테이블의 튜플을 col번째 컬럼의 값을 기준으로 오름차순 정렬을 하되, 만약 그 값이 동일하면 기본키인 첫 번째 컬럼의 값을 기준으로 내림차순 정렬합니다. (3) 정렬된 데이터에서 S_i를 i 번째 행의 튜플에 대해 각 컬럼의 값을 i 로 나눈 나머지들의 합으로 정의합니다. (4) row_begin ≤ i ≤ row_end 인 모든 S_i를 누적하여 bitwise XOR 한 값을 해시 값으로서 반환합니다. 테이블의 데이터 data와 해시 함수에 대한 입력 col, row_begin, row_end이 주어졌을 때 테이블의 해시 값을 return 하도록 solution 함수를 완성해주세요. |
def solution(data, col, row_begin, row_end):
data.sort(key=lambda x: (x[col - 1], -x[0]))
answer = 0
for i in range(row_begin - 1, row_end):
row_index = i + 1
S_i = sum(value % row_index
for value in data[i]) answer ^= S_i
return answer
|
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